由于ZAFT恐怖分子引发的尤尼乌斯7坠落事件“BREAK OF THE WORLD”，PLANT的碎片群如雨一般大量降落到地球上，从而导致世界上各大城市被毁灭，前所未有的悲剧诞生了。 　　

　　与此同时，DSSD（深宇宙探察开发机构）开发中心的保安副部长埃德蒙多·杜克罗与DSSD技术员塞蕾娜·马克格利夫也在因受害而被水淹没的街市地区寻找返回开发中心的方法。

　　突然，那里发生了爆炸，受灾地的避难民众和救援部队顿时骚动起来。出现在黑烟前的，是一架不明所属的MS。为了推进已进入最终实验阶段的宇宙探察用MS“GSX-401FW 观星者”的开发计划，目送塞蕾娜离开后的埃德蒙多定睛看着乱放炮弹的不明所属机，脸上浮现出无畏的笑容。

　　另一方面，在Phantom Pain基地目睹惨状的斯威恩·卡尔·巴延等人被下达了出击待机的命令，漆黑的机体开始启动。

　　混乱至极的地上，依然无法看见群星。