可以说事实上已经开战了。自从尤尼乌斯7坠落事件“BREAK OF THE WORLD”发生以来，在世界各个地区地球联合与ZAFT的战斗都趋于激化。

　　建有联合MS研究设施的吉尔吉斯工场也遭到了突如其来的ZAFT的MS的袭击和破坏，研究人员被毫无差别地杀死。就在那时，漆黑的MS自微明的天空中降落，那是隶属于Phantom Pain的斯威恩·卡尔·巴延所驾驶的GAT-X105E 强袭·黑。其以压倒性的战斗能力接连将ZAFT的MS击破，令众人战栗不已。

　　另一方面，宇宙中，在DSSD（深宇宙探察开发机构）的宇宙站关于宇宙探察用新型MS“GSX-401FW 观星者”的机动实验终于即将进行。一直等待着此刻的索尔·鲁尼·朗基和塞蕾娜·马克格利夫，他们的眼睛，与观星者一起仰视着依然看不见的群星的彼方。